Les obligations comptables d’un indépendant dépendent de son activité, de son régime fiscal et de sa situation au regard de la TVA. En 2026, commencez par identifier ces trois éléments. Vous pourrez ensuite vérifier vos registres, vos déclarations, vos échéances sociales et votre organisation pour la facturation électronique.
Quelle comptabilité tenir selon votre régime ?
Micro-entreprise : suivre les recettes et les justificatifs
Le micro-entrepreneur tient une comptabilité allégée, avec notamment un livre des recettes encaissées. Un registre des achats est également requis selon l’activité et la situation fiscale. Les déclarations de chiffre d’affaires à l’Urssaf suivent la périodicité mensuelle ou trimestrielle choisie. La fiche officielle sur les obligations comptables du micro-entrepreneur détaille les registres, la facturation et la conservation des pièces.
Dans votre suivi quotidien, distinguez une facture émise d’un paiement reçu. Conservez le lien entre la recette enregistrée, son mode de règlement et sa pièce justificative. Un tableau de factures en attente ne suffit pas à connaître les encaissements de la période.
BIC au réel : organiser la comptabilité et la clôture
Pour une activité commerciale au régime réel, les obligations comprennent la tenue d’une comptabilité, l’inventaire et l’établissement des comptes, avec des simplifications possibles selon la situation. Consultez la fiche sur les obligations du commerçant en entreprise individuelle pour identifier celles qui vous concernent.
Si vos comptes sont établis selon le Plan comptable général, utilisez le recueil de l’Autorité des normes comptables dans sa version 2026 pour contrôler le paramétrage avec la personne qui tient votre comptabilité. Une règle de présentation des comptes ne doit pas être appliquée indistinctement à tous les indépendants.
BNC en déclaration contrôlée : recettes, dépenses et immobilisations
Les professionnels relevant des BNC en déclaration contrôlée tiennent notamment un livre-journal des recettes et des dépenses ainsi qu’un registre des immobilisations et des amortissements. Ces obligations sont décrites dans le BOFiP consacré à la déclaration contrôlée. Vérifiez avec votre conseil les modalités correspondant aux options de votre activité.
Préparez une fiche qui réunit votre régime, les documents attendus et la répartition des tâches : ce que vous enregistrez, ce que le cabinet récupère et ce qui doit être contrôlé avant la déclaration. Elle sert de référence lors d’un changement d’outil.
TVA : vérifier les seuils séparément du régime micro
Le régime micro-fiscal et la franchise en base de TVA ont des conditions distinctes. Ne reprenez pas une règle de dépassement du régime micro pour déterminer la date à laquelle facturer la TVA.
En 2026, les seuils généraux de franchise sont de 85 000 € pour le commerce et l’hébergement et de 37 500 € pour les prestations de services, avec des seuils majorés respectifs de 93 500 € et 41 250 €. Des règles particulières concernent notamment certaines professions et les activités mixtes. Service Public indique que le projet de seuil unique à 25 000 € a été abandonné.
Le dépassement du seuil de base entraîne une sortie au 1er janvier suivant ; celui du seuil majoré en cours d’année entraîne une sortie dès le jour du dépassement. Vérifiez votre cas dans la fiche officielle sur la franchise en base de TVA.
Contrôlez régulièrement le chiffre d’affaires pertinent et gardez la date des dépassements. Avant la bascule, faites confirmer la date d’effet par votre service des impôts et préparez les mentions de facture, les prix et le suivi de TVA.
Cotisations sociales : contrôler les échéanciers reçus en 2026
Pour les travailleurs indépendants concernés, la réforme de l’assiette sociale et des barèmes est mise en œuvre à la suite de la déclaration en 2026 des revenus de 2025. Elle ne doit pas être transposée au régime micro-social. La présentation officielle de la réforme des cotisations en explique le calendrier et le périmètre.
Rapprochez le nouvel échéancier de vos provisions et distinguez la régularisation de l’année précédente des cotisations provisionnelles de l’année en cours. Pour estimer un impact, utilisez les données de votre situation et les outils de l’Urssaf, puis reportez les paiements dans votre prévision de trésorerie. Une formule isolée ne suffit pas à prévoir l’ensemble des cotisations.
Facturation électronique : réception en 2026, émission en 2027 pour les petites entreprises
Depuis le 1er septembre 2026, les entreprises établies en France et assujetties à la TVA doivent pouvoir recevoir les factures électroniques de leurs fournisseurs concernés. Les entreprises en franchise en base, dont les micro-entrepreneurs, entrent aussi dans le périmètre de la réforme. La présentation de la DGFiP explique le rôle des plateformes agréées et les opérations couvertes.
- Grandes entreprises et ETI : obligation d’émission et de transmission des données applicable depuis le 1er septembre 2026.
- PME et micro-entreprises : obligation d’émission et de transmission des données à partir du 1er septembre 2027, selon les opérations concernées.
Ce calendrier officiel comporte notamment un cas particulier pour les membres d’un assujetti unique à la TVA. Vérifiez aussi les règles propres aux opérations exonérées et à vos échanges avec des particuliers ou des clients étrangers.
À ce stade, vérifiez que votre plateforme agréée est choisie, que l’adresse de réception est opérationnelle et que vous savez retrouver les factures reçues. Demandez à votre éditeur comment votre logiciel communique avec cette plateforme. Un PDF ordinaire envoyé par courriel ne suffit pas pour une facture entrant dans l’obligation de facturation électronique. Notre dossier sur la facturation électronique permet de poursuivre la préparation.
FEC : une obligation à distinguer de la facturation électronique
Le fichier des écritures comptables, ou FEC, sert à présenter une comptabilité informatisée à l’administration dans le cadre d’un contrôle. Le BOFiP sur la remise du FEC précise le champ de l’obligation et les dispenses, dont celle des auto-entrepreneurs. Il ne s’agit pas d’un nouveau format de facture imposé à tous les indépendants en 2026.
Si vous êtes concerné, identifiez le logiciel ou le cabinet qui produit le fichier. Faites vérifier un export représentatif, avec les écritures d’ouverture, les factures, les avoirs et les règlements. Un export de ventes destiné à la comptabilité ne constitue pas, à lui seul, le FEC complet de l’entreprise.
Une routine de contrôle pour garder les données cohérentes
- Classer les justificatifs et repérer les pièces manquantes.
- Rapprocher les règlements des factures et expliquer les écarts.
- Vérifier les échéances fiscales et sociales correspondant au régime.
- Contrôler les seuils de TVA et les éventuels changements de situation.
- Tester les échanges de données avec la plateforme et le cabinet comptable.
Le logiciel Kwixéo pour indépendants permet d’organiser le suivi commercial de l’activité. Pendant l’essai gratuit, rejouez un cycle devis, facture et règlement, puis faites valider les données attendues par la personne chargée de votre comptabilité.
